RNAi文庫(kù)是什么?
RNAi (RNA interference,RNA干擾),是近年來(lái)發(fā)現(xiàn)的在生物體內(nèi)普遍存在的***種古老的生物學(xué)現(xiàn)象,是由雙鏈RNA(dsRNA)介導(dǎo)的、由特定酶參與的特異性基因沉默現(xiàn)象,它在轉(zhuǎn)錄水平、轉(zhuǎn)錄后水平和翻譯水平上阻斷基因的表達(dá)。
RNAi現(xiàn)象***早是在秀麗線蟲(chóng)中發(fā)現(xiàn)的。RNAi的機(jī)制可能是細(xì)胞內(nèi)雙鏈RNA在Dicer酶的作用下,可形成21nt~23nt的小干擾 RNA(small interfering RNAs,siRNAs),siRNAs可進(jìn)***步摻入到多組分核酸酶(multicomponent nuclease,RISC)中并使其激活,從而精確降解與siRNAs序列相同的mRNA,完全抑制該基因在細(xì)胞內(nèi)的翻譯和表達(dá)。
獨(dú)立的siRNA可用于研究單個(gè)基因的功能,可是后基因組時(shí)代的***,研究人員已經(jīng)不滿足于“***次缺失—— ***個(gè)基因”這樣的研究節(jié)奏,功能基因組學(xué)的研究更需要***個(gè)能站在全局高度研究多個(gè)基因之間關(guān)系的工具,因此,shRNA/siRNA文庫(kù)應(yīng)運(yùn)而生。 shRNA/siRNA文庫(kù)聯(lián)合使用高通量篩選技術(shù)和高內(nèi)涵圖像分析技術(shù),使得RNAi篩選在反向基因組學(xué)、功能基因研究、藥物發(fā)現(xiàn)等多個(gè)領(lǐng)域成為了***個(gè) 強(qiáng)大的應(yīng)用工具。
RNAi是指***些小的與靶基因序列同源的雙鏈RNA ( dsRNA)可以高效、特異性地阻斷體內(nèi)特定基因表達(dá),促使mRNA降解,誘使細(xì)胞表現(xiàn)出特定基因缺失的表型,它也是體內(nèi)抵御外在感染的***種重要保護(hù)機(jī)制。
較長(zhǎng)ds RNA在ATP參與下被RNase皿樣的特異核酸酶切割加工成21 ~23nt的由正義和反義鏈組成的小千擾RNA(smallinterfering RNA, siRNA)。siRNA 在ATP參與下被RNA解旋酶解旋成單鏈,并由其中反義鏈指導(dǎo)形成RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合體[RISC) ,沉默同源靶基因。轉(zhuǎn)基因真核生物中的dsRNA尚可引起相應(yīng)基因的甲基化和染色質(zhì)重構(gòu)、凝集、異染色質(zhì)化,***終導(dǎo)致基因沉默。